Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE12

LMX1A, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMX1AQ8TE12 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMX1AQ8TE12 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMX1AQ8TE12 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMX1AQ8TE12 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMX1AQ8TE12 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMX1AQ8TE12 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMX1AQ8TE12 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMX1AQ8TE12 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMX1AQ8TE12 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMX1AQ8TE12 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMX1AQ8TE12 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMX1AQ8TE12 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMX1AQ8TE12 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMX1AQ8TE12 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMX1AQ8TE12 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LMX1AQ8TE12 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMX1AQ8TE12 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMX1AQ8TE12 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMX1AQ8TE12 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMX1AQ8TE12 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms