Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VN1R17PQ8TDU5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VN1R17PQ8TDU5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VN1R17PQ8TDU5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms