Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC90

CCER1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER1Q8TC90 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCER1Q8TC90 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CCER1Q8TC90 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCER1Q8TC90 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms