Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MDM1Q8TC05 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MDM1Q8TC05 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms