Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB92

HMGCLL1, 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCLL1Q8TB92 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGCLL1Q8TB92 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGCLL1Q8TB92 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGCLL1Q8TB92 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGCLL1Q8TB92 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGCLL1Q8TB92 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGCLL1Q8TB92 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGCLL1Q8TB92 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGCLL1Q8TB92 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGCLL1Q8TB92 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCLL1Q8TB92 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCLL1Q8TB92 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCLL1Q8TB92 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCLL1Q8TB92 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCLL1Q8TB92 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCLL1Q8TB92 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGCLL1Q8TB92 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGCLL1Q8TB92 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGCLL1Q8TB92 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.5 ms