Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KNL1Q8NG31 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KNL1Q8NG31 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KNL1Q8NG31 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1360.2 ms