Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BEST2Q8NFU1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BEST2Q8NFU1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BEST2Q8NFU1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms