Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BEST4Q8NFU0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BEST4Q8NFU0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BEST4Q8NFU0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms