Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KLHDC9Q8NEP7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KLHDC9Q8NEP7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHDC9Q8NEP7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms