Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEC5

CATSPER1, Cation channel sperm-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER1Q8NEC5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPER1Q8NEC5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER1Q8NEC5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER1Q8NEC5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER1Q8NEC5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER1Q8NEC5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER1Q8NEC5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER1Q8NEC5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER1Q8NEC5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER1Q8NEC5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER1Q8NEC5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CATSPER1Q8NEC5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPER1Q8NEC5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPER1Q8NEC5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPER1Q8NEC5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPER1Q8NEC5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPER1Q8NEC5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CATSPER1Q8NEC5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CATSPER1Q8NEC5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CATSPER1Q8NEC5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CATSPER1Q8NEC5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CATSPER1Q8NEC5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CATSPER1Q8NEC5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms