Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM35BQ8NCS4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM35BQ8NCS4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM35BQ8NCS4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms