Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMYD1Q8NB12 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMYD1Q8NB12 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMYD1Q8NB12 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms