Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC63Q8NA47 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms