Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FSIP1Q8NA03 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
FSIP1Q8NA03 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms