Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7F7

UBL4B, Ubiquitin-like protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4BQ8N7F7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBL4BQ8N7F7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBL4BQ8N7F7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBL4BQ8N7F7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms