Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L1

KRTCAP2, Keratinocyte-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTCAP2Q8N6L1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRTCAP2Q8N6L1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRTCAP2Q8N6L1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms