Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RPAP2Q8IXW5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RPAP2Q8IXW5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms