Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX05

CD302, CD302 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD302Q8IX05 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD302Q8IX05 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD302Q8IX05 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD302Q8IX05 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD302Q8IX05 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD302Q8IX05 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD302Q8IX05 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD302Q8IX05 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD302Q8IX05 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD302Q8IX05 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD302Q8IX05 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD302Q8IX05 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD302Q8IX05 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD302Q8IX05 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD302Q8IX05 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD302Q8IX05 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD302Q8IX05 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CD302Q8IX05 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CD302Q8IX05 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CD302Q8IX05 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms