Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWX8

CHERP, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHERPQ8IWX8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHERPQ8IWX8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHERPQ8IWX8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHERPQ8IWX8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms