Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV53

DENND1C, DENN domain-containing protein 1C, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1CQ8IV53 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DENND1CQ8IV53 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DENND1CQ8IV53 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND1CQ8IV53 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND1CQ8IV53 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND1CQ8IV53 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DENND1CQ8IV53 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms