Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ALYREFQ86V81 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ALYREFQ86V81 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ALYREFQ86V81 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms