Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF39Q86UA1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF39Q86UA1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF39Q86UA1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms