Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC6BQ86SZ2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
TRAPPC6BQ86SZ2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC6BQ86SZ2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC6BQ86SZ2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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