Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMC1Q7Z7K0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CMC1Q7Z7K0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMC1Q7Z7K0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMC1Q7Z7K0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CMC1Q7Z7K0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMC1Q7Z7K0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMC1Q7Z7K0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMC1Q7Z7K0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMC1Q7Z7K0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMC1Q7Z7K0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMC1Q7Z7K0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMC1Q7Z7K0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMC1Q7Z7K0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMC1Q7Z7K0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMC1Q7Z7K0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMC1Q7Z7K0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMC1Q7Z7K0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMC1Q7Z7K0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMC1Q7Z7K0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMC1Q7Z7K0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMC1Q7Z7K0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMC1Q7Z7K0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMC1Q7Z7K0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMC1Q7Z7K0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMC1Q7Z7K0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMC1Q7Z7K0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms