Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RD3Q7Z3Z2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RD3Q7Z3Z2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RD3Q7Z3Z2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms