Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC80Q76M96 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms