Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PREX2Q70Z35 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
PREX2Q70Z35 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PREX2Q70Z35 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms