Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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USP43Q70EL4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP43Q70EL4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
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USP43Q70EL4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
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USP43Q70EL4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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USP43Q70EL4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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USP43Q70EL4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
USP43Q70EL4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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