Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY4Q6ZNE9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RUFY4Q6ZNE9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY4Q6ZNE9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY4Q6ZNE9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY4Q6ZNE9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY4Q6ZNE9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY4Q6ZNE9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY4Q6ZNE9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms