Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CASC2Q6XLA1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CASC2Q6XLA1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms