Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NSMFQ6X4W1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NSMFQ6X4W1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NSMFQ6X4W1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms