Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRIG3Q6UXM1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRIG3Q6UXM1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRIG3Q6UXM1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms