Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VSTM1Q6UX27 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VSTM1Q6UX27 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VSTM1Q6UX27 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VSTM1Q6UX27 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms