Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ATRAIDQ6UW56 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATRAIDQ6UW56 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATRAIDQ6UW56 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms