Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMBQ6PCB8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EMBQ6PCB8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EMBQ6PCB8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms