Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RWDD4Q6NW29 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RWDD4Q6NW29 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RWDD4Q6NW29 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms