Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDF6Q6KF10 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDF6Q6KF10 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDF6Q6KF10 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GDF6Q6KF10 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDF6Q6KF10 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDF6Q6KF10 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GDF6Q6KF10 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF6Q6KF10 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF6Q6KF10 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF6Q6KF10 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF6Q6KF10 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF6Q6KF10 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF6Q6KF10 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF6Q6KF10 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF6Q6KF10 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GDF6Q6KF10 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GDF6Q6KF10 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GDF6Q6KF10 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GDF6Q6KF10 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GDF6Q6KF10 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GDF6Q6KF10 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GDF6Q6KF10 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
GDF6Q6KF10 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms