Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SDE2Q6IQ49 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SDE2Q6IQ49 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDE2Q6IQ49 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDE2Q6IQ49 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms