Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EEF1DP3Q658K8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EEF1DP3Q658K8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EEF1DP3Q658K8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms