Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
C9orf57Q5W0N0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C9orf57Q5W0N0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf57Q5W0N0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf57Q5W0N0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf57Q5W0N0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf57Q5W0N0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf57Q5W0N0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf57Q5W0N0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf57Q5W0N0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf57Q5W0N0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf57Q5W0N0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C9orf57Q5W0N0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf57Q5W0N0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf57Q5W0N0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf57Q5W0N0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C9orf57Q5W0N0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf57Q5W0N0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf57Q5W0N0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C9orf57Q5W0N0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C9orf57Q5W0N0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf57Q5W0N0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf57Q5W0N0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf57Q5W0N0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C9orf57Q5W0N0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms