Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ECM29Q5VYK3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
ECM29Q5VYK3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ECM29Q5VYK3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ECM29Q5VYK3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms