Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GARNL3Q5VVW2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GARNL3Q5VVW2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GARNL3Q5VVW2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms