Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
C9orf135Q5VTT2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms