Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HES3Q5TGS1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES3Q5TGS1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES3Q5TGS1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms