Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RSPH4AQ5TD94 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RSPH4AQ5TD94 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RSPH4AQ5TD94 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RSPH4AQ5TD94 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RSPH4AQ5TD94 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RSPH4AQ5TD94 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
RSPH4AQ5TD94 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RSPH4AQ5TD94 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
RSPH4AQ5TD94 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
RSPH4AQ5TD94 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RSPH4AQ5TD94 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RSPH4AQ5TD94 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
RSPH4AQ5TD94 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms