Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2LQ5T4T6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYCP2LQ5T4T6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms