Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CEP170Q5SW79 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CEP170Q5SW79 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
CEP170Q5SW79 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CEP170Q5SW79 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
CEP170Q5SW79 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CEP170Q5SW79 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CEP170Q5SW79 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CEP170Q5SW79 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CEP170Q5SW79 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
CEP170Q5SW79 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
CEP170Q5SW79 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CEP170Q5SW79 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
CEP170Q5SW79 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CEP170Q5SW79 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CEP170Q5SW79 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CEP170Q5SW79 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
CEP170Q5SW79 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CEP170Q5SW79 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CEP170Q5SW79 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CEP170Q5SW79 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CEP170Q5SW79 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
CEP170Q5SW79 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CEP170Q5SW79 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CEP170Q5SW79 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CEP170Q5SW79 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CEP170Q5SW79 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CEP170Q5SW79 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CEP170Q5SW79 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CEP170Q5SW79 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CEP170Q5SW79 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CEP170Q5SW79 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
CEP170Q5SW79 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CEP170Q5SW79 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
CEP170Q5SW79 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
CEP170Q5SW79 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC38.08■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
CEP170Q5SW79 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CEP170Q5SW79 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms