Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATAT1Q5SQI0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATAT1Q5SQI0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATAT1Q5SQI0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms