Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAMD4BQ5PRF9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAMD4BQ5PRF9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAMD4BQ5PRF9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms