Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HABP4Q5JVS0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HABP4Q5JVS0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HABP4Q5JVS0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HABP4Q5JVS0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HABP4Q5JVS0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HABP4Q5JVS0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HABP4Q5JVS0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HABP4Q5JVS0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HABP4Q5JVS0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HABP4Q5JVS0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HABP4Q5JVS0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HABP4Q5JVS0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HABP4Q5JVS0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HABP4Q5JVS0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HABP4Q5JVS0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HABP4Q5JVS0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HABP4Q5JVS0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HABP4Q5JVS0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HABP4Q5JVS0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HABP4Q5JVS0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HABP4Q5JVS0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HABP4Q5JVS0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HABP4Q5JVS0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HABP4Q5JVS0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HABP4Q5JVS0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HABP4Q5JVS0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HABP4Q5JVS0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms